Характерная особенность системы воздухоносных путей — обнаружение разнообразных бактерий (в том числе патогенных) в верхних отделах и относительная стерильность зон газообмена. Поражения дыхательных путей доминируют среди всей инфекционной патологии. Материал отбирают с учётом симптомов, указывающих на поражение тех или иных отделов дыхательного тракта. Чаще исследуют слизь из носа, носоглотки, зева, мокроту и промывные воды бронхов. Значительно реже изучают биоптаты лёгких, аспираты трахеи. Микробы верхних дыхательных путей Материал забирают натощак до чистки зубов и споласкивания полостей рта, носа и глотки.

При заборе материала из носа используют тампоны, отдельные для каждой ноздри. При отсутствии секрета тампоны можно смочить 0,9% раствором NaCl. Правильная техника забора материала из зева имеет решающее значение. Нельзя прикасаться тампоном к слизистой оболочке полости рта и языка. Поскольку микроорганизмы располагаются неравномерно, следует, используя один тампон, сначала обтереть правую миндалину, затем — нёбную дужку, язычок, левую миндалину и заднюю стенку глотки. Носовые ходы. Наиболее часто выделяют дифтероиды, коагулаза-отрицательные стафилококки, бета-гемолитические стрептококки, нейссерии и др. Также можно обнаружить носительство коагузаза-по ложительного S. aureus, кишечной палочки, р- гемолитических стрептококков и др. У детей обнаруживают более разнообразный спектр микроорганизмов с доминированием грамотрицательной микрофлоры.