Streptococcus pneumoniae зачастую длительно существует в носоглотке здоровых детей. Бессимптомное носительство среди детей младшего возраста встречается особенно часто и может вызывать передачу пневмококка другим детям воздушно-капельным путём. Этот микроорганизм вызывает фарингит, средний отит, конъюнктивит, синусит, а также системные заболевания — пневмонию, бактериальный сепсис и менингит.

Последние характеризуются высокой заболеваемостью и смертностью и встречаются главным образом у грудных детей, поскольку их иммунная система слабо реагирует на инкапсулированные патогенные микроорганизмы, такие как пневмококк.